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CSET:從出版物看全球生物安全三級(jí) 實(shí)驗(yàn)室分布

日期:2023-02-10 00:00:00
  2022年8月,美國(guó)喬治敦大學(xué)安全與新興技術(shù)中心(CSET)發(fā)布《從出版物看生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室分布》報(bào)告,對(duì)全球范圍內(nèi)生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室的分布情況進(jìn)行了分析。具體來(lái)看,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)2006—2021年期間收錄于美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院生命科學(xué)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù)的約200萬(wàn)篇英語(yǔ)文獻(xiàn)進(jìn)行了關(guān)鍵詞搜索,利用文本挖掘法更加精準(zhǔn)地確定出具有生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu),按照國(guó)別和大洲兩個(gè)維度對(duì)其分布情況進(jìn)行了統(tǒng)計(jì),并得出了幾點(diǎn)結(jié)論。

當(dāng)前,對(duì)病原體的研究為科學(xué)界和政策界提出了一項(xiàng)難題。一方面,這類(lèi)研究為開(kāi)發(fā)疫苗和療法、了解宿主和病原體的相互作用以及預(yù)防大流行病提供了巨大機(jī)會(huì)。但另一方面,這類(lèi)研究可能導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)室事故或潛在的濫用可能,政府和監(jiān)管機(jī)構(gòu)為規(guī)避風(fēng)險(xiǎn)可能會(huì)制定限制性強(qiáng)的法律法規(guī),這將阻礙科學(xué)探索發(fā)現(xiàn)。生物安全三級(jí)(BSL-3)實(shí)驗(yàn)室作為此類(lèi)研究基礎(chǔ)設(shè)施的關(guān)鍵組成部分,能夠確??茖W(xué)家在安全可靠的環(huán)境中對(duì)傳染性病原體進(jìn)行研究。因此,統(tǒng)計(jì)生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室的數(shù)量及其分布,可以幫助把握目前全球各國(guó)正在開(kāi)展傳染性病原體研究的整體情況。
圖1生物安全等級(jí)及其特點(diǎn)和代表疾病

一、研究方法
為了把握全球BSL-3實(shí)驗(yàn)室的分布情況,本研究首先對(duì)2006年至2021年期間發(fā)表,且收錄于PubMed Central[1]的約200萬(wàn)篇英語(yǔ)文獻(xiàn)進(jìn)行了關(guān)鍵詞搜索(BSL-3,biosafety level 3或biological safety level 3)。在涉及上述關(guān)鍵詞的文獻(xiàn)中,研究團(tuán)隊(duì)根據(jù)作者的自我報(bào)告,確定出具有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)及其所在位置。此前的研究主要依靠調(diào)查已知的機(jī)構(gòu)來(lái)確定BSL-3實(shí)驗(yàn)室的位置分布和特征,而CSET以期刊論文為研究對(duì)象,通過(guò)文本挖掘法,更加精準(zhǔn)地捕捉到了擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)。需要注意的是,本研究的分析數(shù)據(jù)不包括以下幾種情況:未將研究成果發(fā)表的BSL-3實(shí)驗(yàn)室,如參比實(shí)驗(yàn)室和臨床診斷實(shí)驗(yàn)室[2];出版物未收錄在PubMed Central (無(wú)論其研究是否發(fā)表)的BSL-3實(shí)驗(yàn)室;出版物收錄在PubMed Central,但并非用英語(yǔ)撰寫(xiě)文章的實(shí)驗(yàn)室;未在出版物方法論部分使用BSL-3生物防護(hù)方法(biocontainment methods)進(jìn)行自我報(bào)告的實(shí)驗(yàn)室。
二、全球BSL-3實(shí)驗(yàn)室分布
本研究首先對(duì)各國(guó)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)現(xiàn)狀進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析。如圖2所示,美國(guó)和中國(guó)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)數(shù)量分列世界第一(148所)和第二位(69所)。與美中兩國(guó)相比,其他國(guó)家擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)數(shù)量明顯減少,印度、德國(guó)、西班牙、法國(guó)、日本、韓國(guó)、意大利和荷蘭有18所到8所不等的機(jī)構(gòu)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室。
研究指出,美國(guó)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)類(lèi)型具有更廣泛的代表性,反映出美國(guó)研發(fā)體系的分散性質(zhì),其148所擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)分布在美國(guó)各地的聯(lián)邦研究中心、高校和企業(yè)中。中國(guó)對(duì)生物技術(shù)研發(fā)的重視可能是其擁有數(shù)量眾多BSL-3實(shí)驗(yàn)室的原因,與美國(guó)相比,中國(guó)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)主要集中在國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、部隊(duì)醫(yī)院以及與中央政府關(guān)系密切的“雙一流”研究型高校中,這反映出中國(guó)研發(fā)體系具有集中性的特點(diǎn)。俄羅斯只有4家擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室機(jī)構(gòu)用英語(yǔ)發(fā)表了文章,這些機(jī)構(gòu)都是聯(lián)邦研究中心,這可能反映出俄羅斯科學(xué)家傾向于用俄語(yǔ)發(fā)表論文,或者相關(guān)研究涉及機(jī)密或軍事目的,也可能反映出俄羅斯由于科研機(jī)構(gòu)重組和科學(xué)家數(shù)量減少等原因?qū)е聯(lián)碛蠦SL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)減少。
PubMed Central (PMC)是美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生研究院提供的一項(xiàng)服務(wù),用于存檔生物醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)領(lǐng)域的科研文獻(xiàn)。
[2]許多BSL-3機(jī)構(gòu)是通過(guò)國(guó)內(nèi)外合作建立的國(guó)家參比實(shí)驗(yàn)室和臨床診斷設(shè)施,它們通常在學(xué)術(shù)環(huán)境之外發(fā)揮作用,以為疾病提供診斷和參考信息。例如,美國(guó)國(guó)際開(kāi)發(fā)署支持吉爾吉斯斯坦、贊比亞等多國(guó)設(shè)立BSL-3參比實(shí)驗(yàn)室,其目的并非研究,而是診斷和監(jiān)測(cè)地方性結(jié)核病,并為實(shí)驗(yàn)室人員提供培訓(xùn)和資源。
圖2各國(guó)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)數(shù)量


按照大洲來(lái)看,雖然北美洲只有4個(gè)國(guó)家擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室,但其總量比其他大洲都多。在北美洲擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的157所機(jī)構(gòu)中,有148所位于美國(guó),其余位于加拿大、墨西哥和海地。亞洲有18個(gè)國(guó)家的機(jī)構(gòu)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室,共140所,其中中國(guó)占近一半。單個(gè)歐洲國(guó)家擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)數(shù)量較少,但它們加起來(lái)約占全球總量的1/4。其中,德國(guó)、西班牙、法國(guó)、意大利和荷蘭分別有超過(guò)8所擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)。非洲有11個(gè)國(guó)家的機(jī)構(gòu)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室,其中南非最多,7所機(jī)構(gòu)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室。南美洲有5個(gè)國(guó)家的機(jī)構(gòu)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室,其中巴西最多,5所機(jī)構(gòu)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室。大洋洲只有澳大利亞的3所機(jī)構(gòu)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室。
研究發(fā)現(xiàn),在北美洲和亞洲,美國(guó)和中國(guó)分別“獨(dú)占鰲頭”,擁有各自區(qū)域內(nèi)絕大多數(shù)的BSL-3實(shí)驗(yàn)室。在歐洲和非洲,一些大型機(jī)構(gòu)的BSL-3實(shí)驗(yàn)室往往作為幾個(gè)周邊國(guó)家的區(qū)域性公共研究空間,因此歐洲和非洲地區(qū)的科研人員很難擁有獨(dú)立的BSL-3實(shí)驗(yàn)室,大多依賴大型機(jī)構(gòu)的基礎(chǔ)設(shè)施開(kāi)展研究,如荷蘭伊拉斯謨醫(yī)學(xué)中心以及世衛(wèi)組織在烏干達(dá)的結(jié)核病參比實(shí)驗(yàn)室。另外,美國(guó)也有類(lèi)似的“區(qū)域性生物安全中心”,供科研人員在高度隔離的安全環(huán)境中進(jìn)行生物安全三級(jí)研究。
圖3各大洲擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)數(shù)量

三、結(jié)論
通過(guò)分析,CSET得出了擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室的機(jī)構(gòu)在全球的分布情況,這有助于加深對(duì)世界各地病原體研究和研究基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)現(xiàn)狀的了解。同時(shí),CSET也得出以下主要結(jié)論:美國(guó)的BSL-3實(shí)驗(yàn)室主要分布在聯(lián)邦研究中心、高校和企業(yè)中,而中國(guó)的BSL-3實(shí)驗(yàn)室主要由國(guó)家級(jí)機(jī)構(gòu)管理并運(yùn)營(yíng),包括國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、部隊(duì)醫(yī)院和高校等,中美兩國(guó)BSL-3實(shí)驗(yàn)室所屬機(jī)構(gòu)類(lèi)型的差異可能反映了兩國(guó)在科研組織方式上的不同;其他國(guó)家和地區(qū)的BSL-3實(shí)驗(yàn)室數(shù)量較少,但不同地區(qū)的機(jī)構(gòu)之間存在密切的合作關(guān)系;在許多BSL-3疾病肆虐的地方,如非洲和中亞地區(qū),并沒(méi)有很多機(jī)構(gòu)擁有BSL-3實(shí)驗(yàn)室,大多數(shù)BSL-3資源被轉(zhuǎn)移到參比實(shí)驗(yàn)室和臨床診斷中心。