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CSET:從出版物看全球生物安全三級 實驗室分布

日期:2023-02-10 00:00:00
  2022年8月,美國喬治敦大學安全與新興技術(shù)中心(CSET)發(fā)布《從出版物看生物安全三級實驗室分布》報告,對全球范圍內(nèi)生物安全三級實驗室的分布情況進行了分析。具體來看,研究團隊對2006—2021年期間收錄于美國國立衛(wèi)生研究院生命科學期刊全文數(shù)據(jù)庫的約200萬篇英語文獻進行了關(guān)鍵詞搜索,利用文本挖掘法更加精準地確定出具有生物安全三級實驗室的機構(gòu),按照國別和大洲兩個維度對其分布情況進行了統(tǒng)計,并得出了幾點結(jié)論。

當前,對病原體的研究為科學界和政策界提出了一項難題。一方面,這類研究為開發(fā)疫苗和療法、了解宿主和病原體的相互作用以及預防大流行病提供了巨大機會。但另一方面,這類研究可能導致實驗室事故或潛在的濫用可能,政府和監(jiān)管機構(gòu)為規(guī)避風險可能會制定限制性強的法律法規(guī),這將阻礙科學探索發(fā)現(xiàn)。生物安全三級(BSL-3)實驗室作為此類研究基礎(chǔ)設(shè)施的關(guān)鍵組成部分,能夠確保科學家在安全可靠的環(huán)境中對傳染性病原體進行研究。因此,統(tǒng)計生物安全三級實驗室的數(shù)量及其分布,可以幫助把握目前全球各國正在開展傳染性病原體研究的整體情況。
圖1生物安全等級及其特點和代表疾病

一、研究方法
為了把握全球BSL-3實驗室的分布情況,本研究首先對2006年至2021年期間發(fā)表,且收錄于PubMed Central[1]的約200萬篇英語文獻進行了關(guān)鍵詞搜索(BSL-3,biosafety level 3或biological safety level 3)。在涉及上述關(guān)鍵詞的文獻中,研究團隊根據(jù)作者的自我報告,確定出具有BSL-3實驗室的機構(gòu)及其所在位置。此前的研究主要依靠調(diào)查已知的機構(gòu)來確定BSL-3實驗室的位置分布和特征,而CSET以期刊論文為研究對象,通過文本挖掘法,更加精準地捕捉到了擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)。需要注意的是,本研究的分析數(shù)據(jù)不包括以下幾種情況:未將研究成果發(fā)表的BSL-3實驗室,如參比實驗室和臨床診斷實驗室[2];出版物未收錄在PubMed Central (無論其研究是否發(fā)表)的BSL-3實驗室;出版物收錄在PubMed Central,但并非用英語撰寫文章的實驗室;未在出版物方法論部分使用BSL-3生物防護方法(biocontainment methods)進行自我報告的實驗室。
二、全球BSL-3實驗室分布
本研究首先對各國擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)現(xiàn)狀進行了統(tǒng)計分析。如圖2所示,美國和中國擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)數(shù)量分列世界第一(148所)和第二位(69所)。與美中兩國相比,其他國家擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)數(shù)量明顯減少,印度、德國、西班牙、法國、日本、韓國、意大利和荷蘭有18所到8所不等的機構(gòu)擁有BSL-3實驗室。
研究指出,美國擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)類型具有更廣泛的代表性,反映出美國研發(fā)體系的分散性質(zhì),其148所擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)分布在美國各地的聯(lián)邦研究中心、高校和企業(yè)中。中國對生物技術(shù)研發(fā)的重視可能是其擁有數(shù)量眾多BSL-3實驗室的原因,與美國相比,中國擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)主要集中在國家重點實驗室、部隊醫(yī)院以及與中央政府關(guān)系密切的“雙一流”研究型高校中,這反映出中國研發(fā)體系具有集中性的特點。俄羅斯只有4家擁有BSL-3實驗室機構(gòu)用英語發(fā)表了文章,這些機構(gòu)都是聯(lián)邦研究中心,這可能反映出俄羅斯科學家傾向于用俄語發(fā)表論文,或者相關(guān)研究涉及機密或軍事目的,也可能反映出俄羅斯由于科研機構(gòu)重組和科學家數(shù)量減少等原因?qū)е聯(lián)碛蠦SL-3實驗室的機構(gòu)減少。
PubMed Central (PMC)是美國國立衛(wèi)生研究院提供的一項服務,用于存檔生物醫(yī)學和生命科學領(lǐng)域的科研文獻。
[2]許多BSL-3機構(gòu)是通過國內(nèi)外合作建立的國家參比實驗室和臨床診斷設(shè)施,它們通常在學術(shù)環(huán)境之外發(fā)揮作用,以為疾病提供診斷和參考信息。例如,美國國際開發(fā)署支持吉爾吉斯斯坦、贊比亞等多國設(shè)立BSL-3參比實驗室,其目的并非研究,而是診斷和監(jiān)測地方性結(jié)核病,并為實驗室人員提供培訓和資源。
圖2各國擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)數(shù)量


按照大洲來看,雖然北美洲只有4個國家擁有BSL-3實驗室,但其總量比其他大洲都多。在北美洲擁有BSL-3實驗室的157所機構(gòu)中,有148所位于美國,其余位于加拿大、墨西哥和海地。亞洲有18個國家的機構(gòu)擁有BSL-3實驗室,共140所,其中中國占近一半。單個歐洲國家擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)數(shù)量較少,但它們加起來約占全球總量的1/4。其中,德國、西班牙、法國、意大利和荷蘭分別有超過8所擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)。非洲有11個國家的機構(gòu)擁有BSL-3實驗室,其中南非最多,7所機構(gòu)擁有BSL-3實驗室。南美洲有5個國家的機構(gòu)擁有BSL-3實驗室,其中巴西最多,5所機構(gòu)擁有BSL-3實驗室。大洋洲只有澳大利亞的3所機構(gòu)擁有BSL-3實驗室。
研究發(fā)現(xiàn),在北美洲和亞洲,美國和中國分別“獨占鰲頭”,擁有各自區(qū)域內(nèi)絕大多數(shù)的BSL-3實驗室。在歐洲和非洲,一些大型機構(gòu)的BSL-3實驗室往往作為幾個周邊國家的區(qū)域性公共研究空間,因此歐洲和非洲地區(qū)的科研人員很難擁有獨立的BSL-3實驗室,大多依賴大型機構(gòu)的基礎(chǔ)設(shè)施開展研究,如荷蘭伊拉斯謨醫(yī)學中心以及世衛(wèi)組織在烏干達的結(jié)核病參比實驗室。另外,美國也有類似的“區(qū)域性生物安全中心”,供科研人員在高度隔離的安全環(huán)境中進行生物安全三級研究。
圖3各大洲擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)數(shù)量

三、結(jié)論
通過分析,CSET得出了擁有BSL-3實驗室的機構(gòu)在全球的分布情況,這有助于加深對世界各地病原體研究和研究基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)現(xiàn)狀的了解。同時,CSET也得出以下主要結(jié)論:美國的BSL-3實驗室主要分布在聯(lián)邦研究中心、高校和企業(yè)中,而中國的BSL-3實驗室主要由國家級機構(gòu)管理并運營,包括國家重點實驗室、部隊醫(yī)院和高校等,中美兩國BSL-3實驗室所屬機構(gòu)類型的差異可能反映了兩國在科研組織方式上的不同;其他國家和地區(qū)的BSL-3實驗室數(shù)量較少,但不同地區(qū)的機構(gòu)之間存在密切的合作關(guān)系;在許多BSL-3疾病肆虐的地方,如非洲和中亞地區(qū),并沒有很多機構(gòu)擁有BSL-3實驗室,大多數(shù)BSL-3資源被轉(zhuǎn)移到參比實驗室和臨床診斷中心。